中小软件企业由于具有专业的技术独创性，所以在市场中占有专门的市场，但从成立之初，中小高科技软件企业就面临很多的问题，特别是到公司壮大发展到一定的阶段，面临业务扩展和市场扩大，公司进入转型阶段，很多公司都是栽倒在这个阶段。但这些公司的管理者往往将原因归结于缺乏资金，而且由于我国加入WTO，诸多国外软件企业纷纷进入国内市场，同时国内软件大型企业的集团化，都对发展壮大中的公司构成了极大的生存压力。

虽然说外部的条件很不利于企业，但是我们还是应该看到中小软件企业内部管理上存在的一些问题：

1、项目管理手段单一，没有系统的项目管理经验，无法应对多个项目的协调管理。软件企业开发运作模式基本上是以项目为单位，员工跟着项目走，一个项目结束后，又到另一个项目，或者在同一个时间里，同时跨几个项目工作，从管理上来说缺乏连续性，本身就比较难于管理，再加上管理手段和管理经验的不足，多个项目的综合执行容易受到影响。

2、人员管理方式混乱，过于依赖技术人员，造成技术人员技术和市场两肩挑。很多优秀的开发人员取得一定的业绩后，身不由己地走向他们不一定感兴趣或擅长的管理岗位，但企业又不得不让这些优秀的开发人员转岗。一方面，公司缺乏了一个战斗在最前沿的干将，另一方面，不擅长管理可能给公司未来发展带来非常重大的影响，如何解决这样的矛盾成为众多企业的困惑。

3、客户管理停留在初级阶段，简单而粗放。软件企业由于市场变化和技术变化快速，组织结构及人事变动频繁，所以客户管理无法保持一贯性，容易出现客户管理流于形式的现象。

4、技术管理制度不合理，技术管理难于开展。由于软件产品是一种智力投入，是程序的集合，产品形态是无型的，开发过程比较抽象，非技术出身的专业管理人员比较难理解和掌握产品的开发过程、产品的特点和出现的各种问题，而软件企业内的沟通往往要基于对产品和技术术语的理解。

5、仍把市场当作公司整个管理的出发点和导向，没有形成系统、规范的管理思维。由于中小软件企业基础管理薄弱及外部环境变化快，企业对战略并没有投入太多的时间去思考和策划，企业未来的发展方向比较模糊，大部分是跟着市场走，跟着感觉走，缺乏比较明确的战略指导方针，缺乏核心的价值观。